Аквариумные фильтры, как внутренний, так и внешний, не могут справиться с осадком, но отфильтровывают только взвесь, а также превращают высокотоксичные вещества, которые растворены в воде аквариума, в менее токсичные (биологическая фильтрация во внешнем фильтре). Осадок приходится убирать сифоном с трубкой. Если Вас беспокоит частая замена большого объёма воды в аквариуме, то воду, которая поступает в сифон, можно отфильтровывать через мелкий газ (разновидность ткани) и возвращать обратно в аквариум. Учитывая малый объем Вашего акватеррариума, предпочтительнее было бы заменять откаченную воду на свежую. Периодическая подмена воды на свежую необходима в любом случае, чтобы снизить концентрацию растворенных в воде токсичных соединений.
Внутренние фильтры мне кажутся лишним устройством в любом аквариуме, кроме, быть может, самых маленьких нано-аквариумов. По моему мнению, такие фильтры создают лишнюю вибрацию и чрезмерно сильное течение воды, а их фильтрующие свойства весьма ограничены, особенно то, что касается биологической фильтрации.